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(1)曝气池启动阶段，即活性污泥培养初期，当活性污泥的菌胶团性能和状态尚未形成良好时，有机负荷率较高而DO含量较低。在大量游离菌存在于混合液中的情况下，也会有大量的游泳型的纤毛虫类原生动物，如豆形虫、肾形虫、草履虫等。 (2)当混合液中溶解氧不足时，钟虫头部顶端会突出一个空泡，俗称“头项气泡”。此时应立即检测溶解氧值并进行调整。当溶氧过低时，大量钟形虫死亡，数量急剧减少。需要及时采取降低进水负荷和增加曝气量等有效措施。 (3)当活性污泥分散解体时，出水变得非常浑浊，此时出现的原生动物主要是小变形虫，如辐射变形虫等。这些原生动物体积小构造简单，以细菌为食，移动缓慢。如果发现如此大量的原生动物出现，应减少回流污泥量，并立即增加曝气量。 (4)当进水pH值突然变化并超过正常范围(PH=6~9)时，可观察到钟虫处于非活动状态，纤毛停止摆动，这是应立刻检测进水的PH值，并采取必要措施，调整pH值。 (5)原生动物比细菌对周围环境的变化更敏感。当冲击负荷和有毒物质进入时，作为活性污泥中高度敏感的原生动物，盾纤虫的数量会急剧减少。 (6)活性污泥性能不好时，会出现鞭毛虫类原生动物，只有波豆虫属和屋滴虫属出现，当活性污泥状态恶化时，原生动物和后生动物就会消失。 (7)上述生物相观察只是一种定性的方法，方便快捷但却反严密性。在运行中，只能作为物理和化学方法的补充手段，不能作为主要的过程监控方法。
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